职业教育委员会
第六期 R语言临床医学实战应用专题培训班
日期:2024-06-28

第六期R语言临床医学实战应用专题培训班

各企事业单位、高等院校及科研院所

R 语言作为一款免费开源的统计软件,已逐渐成为医学科研工作者分析数据的首选软件,很多发表在顶级医学杂志的论文,尤其是涉及复杂统计分析方法,可以帮助我们更好地理解数据、揭示趋势、发现规律,从而提高研究质量和数据可靠性。

R语言是一个功能强大且广泛使用的统计分析工具,尤其在医学统计领域有着重要的地位,可以帮助医学科研人员更好地处理和分析医学数据,如临床试验数据、病历数据、生物医学图像等。同时R语言具有可视化能力、机器学习和人工智能能力,能更好地展示和解释数据,并进行数据分析和预测,如药效预测、疾病预测等。

临床医生科研本就薄弱,做实验攒数据劳心劳力?

评职称拿基金全要拼 SCI 文章?

好不容易得到测序数据,聚类分析,富集分析还是不会做?

想做Paper中那样酷炫的分析,但是完全不知道该怎么入手?

想做高水平的科学数据分析图,但是连个热图都画不出来?

中国社科教育培训中心职业教育委员会http://www.cssttcec.org.cn )联合工业与信息化技术培训网http://www.itcc.ac.cn )特举办R语言临床医学实战应用专题培训班”。具体通知如下:

一、培训目标:

    1,此次培训围绕R语言基础知识、数据可视化、统计分析等方面展开,并结合医学实际案例进行分析:深入讲解R语言的理论和实操技巧及编程的基础思路。

    2,让学员掌握 PCA、共表达、聚类分析、Heatmap、富集、Cytoscape 等分析,掌握 GEO 数据库数据的下载、挖掘:

二、主讲专家:

来自清华大学、上海交通大学、中国科学院等高校医学生物信息学学科带头人、擅长各类型医学数据统计分析、生物医学大数据挖掘。发表数十篇专业领域内学术论文及SCI论文,主编或参与编写多部著作。参与多家三甲医院临床生物信息学的研究合作,科研及授课经验很丰富。

三、培训时间:    20240712— 20240715   远程在线培训

                         (第一天数据及操作软件调试,共授课三天)

四、参加对象:

各省市、自治区从事临床医学、基础医学、生物医学工程等科室主任医师、副主任医师、住院医师等临床科研工作者相关人员;国内各重点大学、科研院所相关研究领域的博士、硕士相关研究生和学者等:

五、课程大纲:

一、R语言基本语法

1R语言介绍

2R的获取与安装

3,工作空间

4,输入和输出

5R包的安装、载入和使用

6,数据结构:向量、矩阵、数组、数据框、因子、列表

7,数据的输入:文本、excel

8,答疑

二、R语言统计

1,描述性统计的计算和可视化

2,相关性

3t检验:独立样本、非独立样本、多组比较

4,组间差异比较和可视化

5,回归

6,方差分析

7.主成分分析    

8,答疑

三、R语言画图

1,散点图

2,折线图

3,相关图:散点、圈图、网络图

4. ggplot2包绘图

5,复杂图形的绘制:火山图、热图、圈图、桑基图、生存曲线、ROC曲线、诺莫图、upset图、曼哈顿图、瀑布图、气泡图、小提琴图、韦恩图、雷达图、棒棒糖图、GSEA富集图、森林图、PCA图等等。

6.R语言高级图形的绘制

7.R语言绘图代码的修改和调换

8,答疑

四、R语言临床医学应用实战

1R语言分析肿瘤性疾病示例

TCGA数据下载

TCGA差异分析

功能富集分析

蛋白质互作网络分析

表达分析

生存分析

单因素cox回归分析

多因素cox回归分析

免疫分析

药敏分析

2R语言分析非肿瘤性疾病示例

GEO数据下载

GEO差异分析

功能富集分析

蛋白质互作网络分析

表达分析

lasso回归分析

logistic回归

预后风险预测

3.     R语言实现机器学习

二分类和多分类问题的线性模型

连续数值预测的决策树模型。

用于数据降维和特征选择

4.     R语言实现深度学习

疾病诊断与预测

医学图像分析

基因组学数据挖掘

5,答疑

五、R语言临床医学应用解析

1R语言生存分析COX回归分析实战

2R语言进行疾病预测的随机森林算法

3R语言临床研究亚组的分析

4R语言疾病预测模型

5R语言分析基因表达数据识别疾病相关的基因

六、辅助课程

1.学后交流、微信群、QQ群建立。

2.咨询、合作,技术团队深入探讨。

3.专题定制化内训。

六、报名联系方式:

联系人期老师                  手机(微信同号):15210196261

电话:010-56129268                官方咨询QQ513692711

E_mailcashq_ict@vip.163.com     网址 http://www.cssttcec.org.cn  

工业与信息化技术培训网:http://www.itcc.ac.cn